En az kurulumu kadar temizlik aşamasının da oldukça hassas bir şekilde yapılması gereken Elektrostatik Filtre temizliği ne yazık ki ihmal edilen konular arasındadır. Özellikle ülkemizde yetkisi dahilinde olmayan amatör insanlar tarafından basit yağ sökücü tarzı temizlik ürünleriyle el yordamıyla yapılmaya çalışılmaktadır. Bu tarz uygulamalardan kesinlikle kaçınılması gerekir. Mümkün oldukça filtrenin içerisinde ki parçalara el değmemesine ve kendi özel ilacı dışında temizlik maddelerinin bulaştırılmamasına dikkat edilmelidir.